Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abce1P61222 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abce1P61222 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms