Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ActbP60710 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ActbP60710 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ActbP60710 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ActbP60710 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms