Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rims4P60191 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms