Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms