Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup43P59235 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup43P59235 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup43P59235 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms