Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps33bP59016 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33bP59016 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms