Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms