Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn4P58404 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn4P58404 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms