Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtnsP57757 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms