Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samsn1P57725 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms