Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gp1bbP56400 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gp1bbP56400 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms