Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CdaP56389 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CdaP56389 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CdaP56389 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CdaP56389 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CdaP56389 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CdaP56389 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CdaP56389 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CdaP56389 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CdaP56389 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CdaP56389 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms