Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pex2P55098 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms