Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad23aP54726 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad23aP54726 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms