Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolgP54099 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolgP54099 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolgP54099 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolgP54099 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolgP54099 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolgP54099 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolgP54099 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolgP54099 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PolgP54099 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolgP54099 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolgP54099 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolgP54099 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolgP54099 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolgP54099 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolgP54099 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolgP54099 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolgP54099 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms