Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fdft1P53798 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms