Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PklrP53657 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PklrP53657 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PklrP53657 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PklrP53657 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PklrP53657 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PklrP53657 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PklrP53657 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PklrP53657 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PklrP53657 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PklrP53657 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PklrP53657 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms