Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cux1P53564 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cux1P53564 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux1P53564 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cux1P53564 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux1P53564 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux1P53564 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cux1P53564 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cux1P53564 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cux1P53564 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms