Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Map3k1P53349 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Map3k1P53349 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms