Protein–RNA interactions for Protein: P52825

Cpt2, Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt2P52825 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpt2P52825 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpt2P52825 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms