Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2e3P52483 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms