Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms