Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorcP51450 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RorcP51450 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorcP51450 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms