Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl9P51410 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl9P51410 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl9P51410 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl9P51410 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl9P51410 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms