Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TspoP50637 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TspoP50637 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TspoP50637 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TspoP50637 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TspoP50637 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TspoP50637 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TspoP50637 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TspoP50637 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TspoP50637 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TspoP50637 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TspoP50637 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TspoP50637 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TspoP50637 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TspoP50637 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TspoP50637 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TspoP50637 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TspoP50637 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TspoP50637 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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