Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbrP50284 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms