Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srp9P49962 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms