Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tmod1P49813 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tmod1P49813 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod1P49813 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tmod1P49813 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Tmod1P49813 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tmod1P49813 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tmod1P49813 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tmod1P49813 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmod1P49813 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Tmod1P49813 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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