Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpreP49446 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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