Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms