Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prox1P48437 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms