Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox2P48432 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms