Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Abcd1P48410 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcd1P48410 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms