Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VdrP48281 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VdrP48281 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VdrP48281 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VdrP48281 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VdrP48281 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VdrP48281 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VdrP48281 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VdrP48281 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms