Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl5P47962 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl5P47962 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms