Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zic1P46684 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms