Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn1bP46414 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms