Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf1P46099 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klf1P46099 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms