Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms