Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msh2P43247 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msh2P43247 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms