Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-2P42586 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms