Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sept1P42209 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sept1P42209 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sept1P42209 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Sept1P42209 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Sept1P42209 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Sept1P42209 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Sept1P42209 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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Sept1P42209 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Sept1P42209 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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