Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc19a1P41438 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc19a1P41438 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms