Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox7P40646 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms