Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TfamP40630 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TfamP40630 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TfamP40630 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TfamP40630 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TfamP40630 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TfamP40630 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TfamP40630 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms