Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ThpoP40226 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ThpoP40226 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ThpoP40226 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms