Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd1P40201 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chd1P40201 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd1P40201 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd1P40201 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Chd1P40201 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd1P40201 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms