Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf2P39429 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms