Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik2P39087 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik2P39087 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms