Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms